Il Nexus è il nucleo dal quale i coloni dovrebbero partire per esplorare Andromeda, il loro nuovo approdo. L'immensa stazione spaziale, però, subisce gravi danni ben prima dell'arrivo delle arche: l'intera missione rischia di essere compromessa, e la direttrice della sicurezza Sloane Kelly dovrà ristabilire l'ordine, cercando al tempo stesso di scoprire la natura della minaccia che ostacola il loro cammino... Se dovesse fallire, sarebbe la fine dell'Iniziativa Andromeda!